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1
お問い合わせ
まずはお問い合わせください。
最適な解析方法について、ご提案させていただきます。
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2
サンプリング・DNA抽出
研究目的と対象環境に基づいて最適なサンプリング戦略を策定します。
環境サンプルの適切な採取方法を設計し、高品質なDNAを抽出します。
汚染を最小限に抑え、微生物の多様性を保持するために案件ごとにカスタマイズした手法を用います。
選択するシーケンス手法 (16S rRNA全長アンプリコン、ショットガン、または両方) に応じて、適切なDNA抽出・精製プロトコルを適用します。
想定期間：1〜2週間
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詳細な研究目的の分析とコンサルテーション
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カスタマイズされたサンプリング計画の策定
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環境サンプルの収集
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目的に応じた高品質DNA抽出・品質評価
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3
シーケンシングデータ取得
最新の次世代シーケンサーを用いて、選択された手法に基づく高精度なシーケンシングを実施します。以下のオプションから、研究目的に最適な手法を選択または組み合わせます：
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16S rRNA全長アンプリコンシーケンス: 細菌の分類学的多様性を高解像度で把握
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ショットガンメタゲノムシーケンス（ショートリード）: 広範な遺伝子レパートリーと機能ポテンシャルの解析
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ショットガンメタゲノムシーケンス（ロングリード）: 複雑な遺伝子構造や反復配列の解析、高精度なゲノム再構築
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ハイブリッドアプローチ: ショートリードとロングリードを組み合わせた包括的な解析
各アプローチに対して、適切なSequencing depthとレプリケートを設定し、信頼性の高いデータ生成を保証します。
想定期間：2〜3週間
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研究目的に適したシーケンシング手法の選択と最適化
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高品質なライブラリ調製とシーケンシングの実行
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初期データ品質評価とQCレポートの作成
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データ取得状況の報告と次段階の調整
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4
データ解析・微生物叢プロファイリング
取得したシーケンスデータを最新のバイオインフォマティクスツールを用いて詳細に解析します。選択されたシーケンス手法に応じて、以下の解析を実施します：
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16S rRNA全長アンプリコン解析:
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高解像度の分類学的同定
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系統解析と多様性指標の算出
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ショットガンメタゲノム解析:
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分類学的および機能的プロファイリング
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代謝経路や機能ポテンシャルの推定
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新規遺伝子や機能の探索
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MAG (Metagenome-Assembled Genome) 解析:
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高品質なゲノムビンの構築
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未培養微生物の機能と生態の推定
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さらに、高度な統計手法と先進的なアルゴリズムを駆使して、環境因子との相関分析や重要な微生物群の同定を行います。
想定期間：3〜4週間
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選択した手法に最適な解析パイプラインの構築
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高精度な分類学的・機能的プロファイリング
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統計解析による有意な相関や差異の検出
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MAG構築と未知微生物の機能推定（該当する場合）
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環境因子との統合解析
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5
結果解釈・レポート作成
解析結果に基づいて、微生物群集の構造や機能、生態学的意義を詳細に解釈します。環境特性や実験条件との関連性を考察し、研究目的に沿った洞察を提供します。
また、研究ニーズに合わせたカスタムレポートを作成し、結果の多角的な視覚化や詳細なデータ分析を行います。
さらに、次のステップの研究戦略についても提案を行い、継続的な研究サポートを提供します。
想定期間：2〜3週間
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微生物群集の構造と機能の包括的な解釈
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環境因子との相関分析と生態学的考察
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新規微生物や機能の詳細な分析（該当する場合）
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高度なデータ可視化と包括的レポートの作成
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フォローアップと今後の研究戦略の提案
環境微生物等の細菌叢·機能解析プロセス
バイオDX
最新のシーケンシング技術と高度なバイオインフォマティクス解析を駆使し、複雑な微生物群集の全容解明に挑みます。16S rRNA解析からショットガンメタゲノム、さらにMAG解析まで、お客様のニーズに応じた柔軟なアプローチで、環境中の未知の微生物や機能の発見をサポートします。
16S rRNA全長アンプリコン解析 (ロングリード)
35,000円〜
(税抜・1サンプル)
先進技術で高解像度に微生物叢をプロファイリング
納期：1ヶ月
ショットガンメタゲノム解析 (ショートリード)
56,000円〜
(税抜・1サンプル)
高解像度の分類学的同定に加え機能的プロファイリング
納期：1ヶ月
